Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt16Q9Z2K1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt16Q9Z2K1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms