Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mbd3Q9Z2D8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms