Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uso1Q9Z1Z0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uso1Q9Z1Z0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uso1Q9Z1Z0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms