Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nek4Q9Z1J2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek4Q9Z1J2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms