Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cog1Q9Z160 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cog1Q9Z160 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog1Q9Z160 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog1Q9Z160 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog1Q9Z160 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cog1Q9Z160 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog1Q9Z160 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog1Q9Z160 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog1Q9Z160 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cog1Q9Z160 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms