Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl8Q9Z121 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl8Q9Z121 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl8Q9Z121 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl8Q9Z121 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl8Q9Z121 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccl8Q9Z121 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl8Q9Z121 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms