Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
S1pr4Q9Z0L1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1pr4Q9Z0L1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1pr4Q9Z0L1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms