Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn1Q9Z0I7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn1Q9Z0I7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms