Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrknQ9WVS6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrknQ9WVS6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrknQ9WVS6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrknQ9WVS6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrknQ9WVS6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrknQ9WVS6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrknQ9WVS6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrknQ9WVS6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrknQ9WVS6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms