Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Extl3Q9WVL6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Extl3Q9WVL6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Extl3Q9WVL6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms