Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms