Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim10Q9WUH5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim10Q9WUH5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim10Q9WUH5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim10Q9WUH5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim10Q9WUH5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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