Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfsf13bQ9WU72 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnfsf13bQ9WU72 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnfsf13bQ9WU72 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms