Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scnn1bQ9WU38 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scnn1bQ9WU38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scnn1bQ9WU38 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms