Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vax2Q9WTP9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vax2Q9WTP9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms