Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trim3Q9R1R2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim3Q9R1R2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trim3Q9R1R2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms