Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Zeb2Q9R0G7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zeb2Q9R0G7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zeb2Q9R0G7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms