Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Lamc3Q9R0B6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lamc3Q9R0B6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lamc3Q9R0B6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Lamc3Q9R0B6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lamc3Q9R0B6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms