Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Col4a3Q9QZS0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a3Q9QZS0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a3Q9QZS0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms