Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Npas3Q9QZQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Npas3Q9QZQ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms