Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdzd4Q9QY39 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdzd4Q9QY39 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms