Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkp3Q9QY23 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkp3Q9QY23 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkp3Q9QY23 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms