Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nufip1Q9QXX8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nufip1Q9QXX8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms