Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXU7

Prok2, Prokineticin-2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok2Q9QXU7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prok2Q9QXU7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prok2Q9QXU7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prok2Q9QXU7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms