Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copg2Q9QXK3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Copg2Q9QXK3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Copg2Q9QXK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms