Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trp53inp1Q9QXE4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms