Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3a1Q9QX15 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clca3a1Q9QX15 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clca3a1Q9QX15 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms