Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PdcQ9QW08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdcQ9QW08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdcQ9QW08 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms