Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga2bQ9QUM0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga2bQ9QUM0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga2bQ9QUM0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms