Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cln8Q9QUK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cln8Q9QUK3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms