Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Csnk1eQ9JMK2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk1eQ9JMK2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk1eQ9JMK2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms