Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp2Q9JLK4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cabp2Q9JLK4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cabp2Q9JLK4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms