Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tgm1Q9JLF6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tgm1Q9JLF6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tgm1Q9JLF6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms