Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CubnQ9JLB4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CubnQ9JLB4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CubnQ9JLB4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms