Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtsmQ9JL96 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CtsmQ9JL96 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms