Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfx5Q9JL61 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfx5Q9JL61 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfx5Q9JL61 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms