Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scamp4Q9JKV5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scamp4Q9JKV5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms