Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtrQ9JKK8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrQ9JKK8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrQ9JKK8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms