Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Uchl3Q9JKB1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Uchl3Q9JKB1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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