Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ercc6l2Q9JIM3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ercc6l2Q9JIM3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ercc6l2Q9JIM3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms