Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nup50Q9JIH2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup50Q9JIH2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup50Q9JIH2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms