Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2ird1Q9JI57 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2ird1Q9JI57 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms