Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms