Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cxcl11Q9JHH5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cxcl11Q9JHH5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcl11Q9JHH5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms