Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hapln2Q9ESM3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hapln2Q9ESM3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms