Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sall1Q9ER74 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sall1Q9ER74 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sall1Q9ER74 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms