Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhojQ9ER71 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms