Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn12Q9ER56 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn12Q9ER56 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn12Q9ER56 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms