Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V1ra8Q9EQ48 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
V1ra8Q9EQ48 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms