Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf1Q9EPU0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf1Q9EPU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms